ウェブディレクトリでは、登録されたウェブサイトに関する情報の
データ構造が、必ず
ツリー構造をなしており、
検索エンジンを用いなくとも目的とする
カテゴリに辿りつけるようになっている。代表的なウェブディレクトリではその中に登録されているウェブサイトを対象とする検索エンジンが併設されている。これをディレクトリ型検索エンジンという。
ウェブディレクトリへの登録は、編集者が自ら選択したり利用者から登録申請されたウェブサイトの掲載可否を審査したうえで、内容を分類し適切な説明を付加するという手順で行われる。